Los pagos se realizan  conforme a la presentación de las documentaciones respectivas o Solicitudes de Transferencias de Recursos (STRs) por parte de las entidades que perciben sus salarios a través del Tesoro Nacional.

A través de la red del Banco Nacional de Fomento (BNF) estarán habilitados para cobrar los funcionarios del Congreso, Cámara de Senadores, Cámara de Diputados, Ministerio del Interior (Administrativos), Ministerio de Defensa (Administrativos), Ministerio de Salud, Ministerio de Justicia, Ministerio de Agricultura, Ministerio de Industria, Jurado de Enjuiciamiento, INTN, Indert, Senacsa, IPA, IPTA, Dinacopa, Dinapi, Sedeco, Infona, Comisión Nacional de Competencia, Agencia Nacional de Tránsito y Seguridad Vial, Consejo Nacional de Educación Superior, Aneaes, Autoridad Regulatoria Radiológica Nuclear.

Por la red del Banco Itaú los funcionarios de la Presidencia de la República, Ministerio de Relaciones Exteriores (servicio local), Ministerio de Hacienda, MOPC, Ministerio de la Mujer, Comisión Nacional contra la Tortura, DIBEN, INDI, Fondo de Cultura, Comisión Nacional de Valores, Erssan, Incoop, Secretaría del Ambiente, Universidad de Canindeyú.

A través del Banco Bilbao Vizcaya Argentaria (BBVA), los del Crédito Agrícola de Habilitación, Universidad de Concepción; Banco Atlas, Universidad Nacional del Este (UNE); Banco Familiar, los del Ministerio de Trabajo, Vicepresidencia de la República; del Banco Continental, los de la Universidad Nacional de Pilar (UNP); del Banco Regional, los de la Universidad Nacional de Itapúa, Unves y UNCA.